先天性角膜病变发病原因：
(一)大泡性角膜病变：
1、有晶体大泡性角膜病变 如青光眼 期，色素膜炎晚期，Fuchs角膜营养不良，穿透角膜移植术后并发虹膜前粘连等。
2、无晶体大泡性角膜病变(aphalric bullous keratopathy, ABK) 白内障术后玻璃接触角膜，术中机械性损伤，化学性损伤(生理盐水，BSS)等。
3、人工日化性大泡性角膜病变(pseudophakic bullous keratopathy,PBK) 早期因素主要是手术本身造成的角膜内皮损伤，术后继发青光眼，人工晶体对内皮细胞直接的机械损伤。后期因素主要是人日化接触虹膜引起的慢性低度虹膜炎(共发生率在前房型和虹膜固定型为1%～10%，而后房型为小于1%)及年龄增长所造成的角膜内皮损伤。
(二)带状角膜病变：
较常见于慢性葡萄膜炎、各种原因引起的高钙血症，如甲状旁腺功能亢进，血磷增高而血钙正常，如慢性肾功能衰竭等病。
1、继发于眼部病变者多见于重症眼病后期，如虹膜睫状体炎 期青光眼、角膜基质炎、眼球萎缩等。
2、继发于外伤者见于长期暴露在外，受汞等化学物质刺激所引起。也可能与长期接触兔毛蒸气和烟雾等有关。非典型的角膜带状病变可见于长期使用缩瞳剂的青光眼患者这类缩瞳剂中含有硝酸苯汞防腐剂。
3、继发于全身病变者多见于血钙增高、甲状旁腺功能亢进、维生素D中毒、结节病肾病和麻风病等。
4、原发性者多与双侧弥漫性脂肪沉着有关。
近年来，有报告玻璃体术后眼内注入硅酮油(silicone oil)等也可引起本病。原因可能是由于房水循环障碍所致。也有人提出，泼尼松龙或磷酸地塞米松等皮质类固醇激素药物长期局部应用由于增加泪液和角膜基质的磷酸盐浓度，也可促使本病发生。
