虹膜定位系统其原理是将波前的影像摄取后，将眼球虹膜的影像做分析，由于每个人的虹膜就如指纹般，其表面样式皆是独一无二的，因此波前与虹膜定位系统将所得的虹膜影像分析比较后，取得相符的虹膜定位点，在进行激光手术实施时，计算出眼球转动角度及偏移位置，适时改变激光治疗的切削角度，做一自动补偿修正，使病人在坐立时的波前检测资料，与在进行激光手术治疗仰卧时取得的眼睛影像得已完全吻合，其能使散光和高阶像差得到更精确地治疗。

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